El convento fue fundado por la Orden de los Concepcionistas en el siglo XVI y en la acutalidad alberga el Parador Nacional de Turismo de Trujillo. El Parador ocupó las dependencias del Convento de Santa Clara en el año 1984. Las antiguas celdas monacales fueron habilitadas para albergar acogedoras habitaciones.
Templo de origen románico, construido sobre los restos de una antigua mezquita árabe. La iglesia consta de tres naves cubiertas con bóvedas de crucería, que albergan sepulcros de nobles trujillanos de los siglos XVI y XVIII. El Retablo Mayor es del siglo XV y es obra de Fernando Gallego. Posee, óleos que representan escenas de la vida de la Virgen.